نمونه برداری پروستات به دو روش از راه مقعد و از راه پرینه انجام می شود. به علت وارد شدن عفونت از راه مقعد به خون در نمونه برداری مقعدی، توصیه می شود که 4 الی 5 روز از آنتی بیوتیک های مناسب که شامل سیپروفلوکساسین و مترونیدازول می شوند با تجویز پزشک معالج استفاده نمایید. از شب قبل فقط مایعات و آبکی استفاده شود و صبح روز نمونه برداری از شیاف های بیزاکودیل که مسهل و پاک کننده انتهاهی روده هستند استفاده شود.

توصیه بسیار مهم دیگر، قطع داروهای رقیق کننده خون از قبیل پلاویکس – اوسویکس و آسپرین یک هفته قبل از نمونه برداری می باشد. ضمناً در صورت داشتن بیماری های قلبی، حتما قبل از نمونه برداری باید توسط پزشک متخصص قلب ویزیت و اجازه نمونه برداری داده شود.